Dosya izinleri, kimlerin script’ler gibi dosyaları okuyabileceğini, yazabileceğini ve yönetebileceğini tanımlar. Bir yükleme aşamasında sizden bir dosyayı CHMOD etmeniz isteniyorsa, dosyaların izinlerini ayarlamanız gerekiyor demektir. Dosya izinleri, FTP programları veya kontrol panelindeki file manager ile değiştirilebilir.

Dosyalar için bazı genel izin dereceleri:

600 Bir dosyanın erişimini engeller
644 Herkes tarafından okunabilen (ör: HTML dökumanları)
666 Okunabilir ve değiştirilebilir dosyalar
755 Herkes tarafından okunabilen ve yönetilebilen dosyalar
777 Herkes tarafından yazılıp düzenlenebilen dosyalar (dikkatli kullanın)

Çoğu CGI script’i 755’e kurulmalıdır. Daha fazla bilgi için script kaynaklarına bakınız.